82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0996 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0996  rare lipoprotein B  100 
 
 		 164 aa  330  5e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1061  rare lipoprotein B  100 
 
 		 164 aa  330  5e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.702288  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1000  rare lipoprotein B  100 
 
 		 164 aa  330  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115178  normal  0.163142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1173  rare lipoprotein B  99.39 
 
 		 164 aa  328  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  93.29 
 
 		 164 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1097  Rare lipoprotein B  91.46 
 
 		 164 aa  310  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0312036  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3448  rare lipoprotein B  91.46 
 
 		 164 aa  310  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.124406  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3270  rare lipoprotein B  90.85 
 
 		 164 aa  308  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.527962  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3312  rare lipoprotein B  90.85 
 
 		 164 aa  307  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000159395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  73.17 
 
 		 164 aa  248  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  71.34 
 
 		 164 aa  246  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0704  rare lipoprotein B  72.5 
 
 		 169 aa  244  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00180129  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2930  rare lipoprotein B  71.95 
 
 		 164 aa  243  6.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.692064  decreased coverage  0.00636409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  69.51 
 
 		 164 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0796  rare lipoprotein B  65.43 
 
 		 165 aa  224  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.256578  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  65.62 
 
 		 164 aa  223  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  46.88 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  47.71 
 
 		 210 aa  142  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004218  LPS-assembly lipoprotein RlpB precursor  43.31 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00101724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  40.76 
 
 		 184 aa  131  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  44.76 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  40.13 
 
 		 184 aa  130  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01221  hypothetical protein  41.4 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  43.66 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  43.66 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  43.66 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0477  rare lipoprotein B  43.62 
 
 		 213 aa  124  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.421577  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1565  rare lipoprotein B  41.38 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1097  LPS-assembly lipoprotein RlpB  40 
 
 		 182 aa  121  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.590366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  41.55 
 
 		 186 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0750  LPS-assembly lipoprotein RlpB  34.16 
 
 		 196 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0690  LPS-assembly lipoprotein RlpB  34.16 
 
 		 196 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0364606  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0807  LPS-assembly lipoprotein RlpB  34.16 
 
 		 196 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.914545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0763  LPS-assembly lipoprotein RlpB  34.16 
 
 		 196 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0704  LPS-assembly lipoprotein RlpB  34.16 
 
 		 196 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.712434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0730  LPS-assembly lipoprotein RlpB  34.78 
 
 		 193 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0031107  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0610  LPS-assembly lipoprotein RlpB  35.4 
 
 		 193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00711824  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0661  LPS-assembly lipoprotein RlpB  35.4 
 
 		 193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0110358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3004  LPS-assembly lipoprotein RlpB  34.78 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00131027  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2985  Rare lipoprotein B  35.4 
 
 		 193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0667  LPS-assembly lipoprotein RlpB  35.4 
 
 		 193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000932859  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0693  LPS-assembly lipoprotein RlpB  35.4 
 
 		 193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00387404  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00599  hypothetical protein  35.4 
 
 		 193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025084  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00610  minor lipoprotein  35.4 
 
 		 193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0274387  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1175  LPS-assembly lipoprotein RlpB  34.46 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1556  rare lipoprotein B  35.67 
 
 		 167 aa  103  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.22375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1190  rare lipoprotein B  31.71 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  27.52 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  27.52 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1310  rare lipoprotein B  30.41 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  28.47 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1377  rare lipoprotein B precursor  29.82 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0925703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  28.14 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  31.47 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4670  rare lipoprotein B  27.7 
 
 		 201 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4848  rare lipoprotein B  27.7 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4795  rare lipoprotein B  27.7 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.167693 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2278  rare lipoprotein B  28.24 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2911  Rare lipoprotein B  26.39 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0480  rare lipoprotein B  31.43 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08990  hypothetical protein  28.19 
 
 		 208 aa  48.5  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518811  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  28.66 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0626  rare lipoprotein B  27.03 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  26.03 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3449  putative lipoprotein  26.54 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2452  putative lipoprotein  26.54 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3414  putative lipoprotein  26.54 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2639  putative lipoprotein  26.54 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1228  putative lipoprotein  26.54 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0369  putative lipoprotein  26.54 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  25.61 
 
 		 183 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3785  rare lipoprotein B  31.13 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  22.22 
 
 		 172 aa  44.3  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  25.85 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  25.18 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  25.85 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3450  putative lipoprotein  26.9 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.978876  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3741  rare lipoprotein B  26.53 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0664658 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  25.85 
 
 		 176 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  24.67 
 
 		 208 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2144  rare lipoprotein B  30.23 
 
 		 173 aa  40.8  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01875  lipoprotein  26.12 
 
 		 181 aa  40.8  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>