17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3130 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3130  type IV pilus assembly protein PilX  100 
 
 		 153 aa  300  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.706597 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3526  hypothetical protein  81.05 
 
 		 153 aa  254  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1060  type IV pilus assembly protein PilX  78.43 
 
 		 153 aa  248  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1127  type IV pilus assembly protein PilX  77.78 
 
 		 153 aa  246  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1162  type IV pilus assembly protein PilX  77.78 
 
 		 153 aa  246  9e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3229  hypothetical protein  77.12 
 
 		 153 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0930  type IV pilus assembly protein PilX  62.34 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.881011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3033  type IV pilus assembly protein PilX  59.74 
 
 		 156 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1200  type IV pilus assembly protein PilX  59.21 
 
 		 144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00971414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1065  type IV pilus assembly protein PilX  59.48 
 
 		 144 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2951  type IV pilus assembly protein PilX  57.59 
 
 		 150 aa  176  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.114107  normal  0.117946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1297  type IV pilus assembly protein PilX  54.78 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1105  type IV pilus assembly protein PilX  57.24 
 
 		 144 aa  156  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.711381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1089  type IV pilus assembly protein PilX  51.61 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2884  type IV pilus assembly protein PilX  53.33 
 
 		 150 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2717  type IV pilus assembly protein PilX  48.34 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1215  hypothetical protein  23.64 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>