10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2920 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2920  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  707    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0848  hypothetical protein  47.68 
 
 		 204 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4263  hypothetical protein  45.91 
 
 		 484 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.294762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1882  hypothetical protein  42.42 
 
 		 236 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3277  hypothetical protein  38.93 
 
 		 211 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.799778  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0024  hypothetical protein  44.44 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666493  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2002  hypothetical protein  32.82 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.199494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1975  hypothetical protein  32.82 
 
 		 256 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0815  hypothetical protein  27.41 
 
 		 257 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0884  hypothetical protein  26.06 
 
 		 253 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>