16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3155 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3155  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  344  4e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2901  hypothetical protein  93.49 
 
 		 169 aa  328  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3564  hypothetical protein  70.91 
 
 		 167 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0240  hypothetical protein  45.78 
 
 		 166 aa  164  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0239  hypothetical protein  43.37 
 
 		 163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3968  hypothetical protein  43.98 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0519  hypothetical protein  42.17 
 
 		 164 aa  135  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0312  hypothetical protein  41.76 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0180  hypothetical protein  41.76 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4154  hypothetical protein  41.76 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4286  hypothetical protein  41.76 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0181  hypothetical protein  41.76 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3838  hypothetical protein  41.76 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3765  hypothetical protein  42.35 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3963  hypothetical protein  42.35 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0616  hypothetical protein  35.58 
 
 		 154 aa  98.2  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>