23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2808 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1225  hypothetical protein  59.8 
 
 		 792 aa  999    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1147  type IV pilus assembly PilZ  58.62 
 
 		 793 aa  988    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3541  type IV pilus assembly PilZ  64.04 
 
 		 805 aa  1091    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0300151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3359  type IV pilus assembly PilZ  58.49 
 
 		 793 aa  986    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3033  type IV pilus assembly PilZ  60.25 
 
 		 805 aa  1011    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3371  type IV pilus assembly PilZ  67.13 
 
 		 804 aa  1131    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3221  type IV pilus assembly PilZ  58.74 
 
 		 793 aa  988    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2815  type IV pilus assembly PilZ  58.84 
 
 		 795 aa  978    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2808  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 796 aa  1641    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000659651 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3220  type IV pilus assembly PilZ  57.86 
 
 		 804 aa  976    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0980  hypothetical protein  57.9 
 
 		 792 aa  948    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.218662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1048  type IV pilus assembly PilZ  60.81 
 
 		 790 aa  1014    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.023963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1009  type IV pilus assembly PilZ  53.79 
 
 		 794 aa  893    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1109  type IV pilus assembly PilZ  60.94 
 
 		 790 aa  1014    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.618893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1044  type IV pilus assembly PilZ  61.06 
 
 		 790 aa  1018    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.713733  hitchhiker  0.00851048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1034  type IV pilus assembly PilZ  51.32 
 
 		 796 aa  836    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1279  type IV pilus assembly PilZ  27.62 
 
 		 840 aa  325  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02992  type IV pilus assembly PilZ  27.66 
 
 		 841 aa  312  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.488872  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03371  hypothetical protein  26.08 
 
 		 782 aa  273  7e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1106  hypothetical protein  27.35 
 
 		 822 aa  264  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1923  hypothetical protein  26.83 
 
 		 779 aa  264  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.453342  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0625  hypothetical protein  27.51 
 
 		 781 aa  263  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.432521  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002635  hypothetical protein  26.04 
 
 		 782 aa  261  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.729255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>