17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1881 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1881  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.779874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0592  hypothetical protein  61.11 
 
 		 131 aa  168  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0913  putative lipoprotein  59.4 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.403622  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0840  putative lipoprotein  59.35 
 
 		 141 aa  166  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0819  hypothetical protein  61.29 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0868  hypothetical protein  66.97 
 
 		 148 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0901  hypothetical protein  57.25 
 
 		 141 aa  163  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.746833  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3278  hypothetical protein  64.15 
 
 		 274 aa  161  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0154434  hitchhiker  0.000533264 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3390  hypothetical protein  57.94 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.420538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3432  hypothetical protein  66.98 
 
 		 175 aa  157  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2534  hypothetical protein  53.02 
 
 		 153 aa  156  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1956  hypothetical protein  62.5 
 
 		 131 aa  151  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.784413  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1125  hypothetical protein  58.18 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0743661  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2466  hypothetical protein  61.26 
 
 		 192 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3425  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.14 
 
 		 276 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1600  hypothetical protein  55.2 
 
 		 133 aa  130  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.039384  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2027  hypothetical protein  45.53 
 
 		 163 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490439  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>