72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1636 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  339  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  81.33 
 
 		 168 aa  289  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  78.92 
 
 		 169 aa  280  9e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  78.92 
 
 		 169 aa  280  9e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  78.92 
 
 		 169 aa  280  9e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  78.92 
 
 		 169 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  77.71 
 
 		 169 aa  278  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  84.08 
 
 		 159 aa  276  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  77.11 
 
 		 169 aa  276  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  77.11 
 
 		 169 aa  276  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  77.11 
 
 		 169 aa  276  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  75.9 
 
 		 169 aa  275  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  79.17 
 
 		 168 aa  273  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  75.45 
 
 		 169 aa  268  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  72.29 
 
 		 169 aa  259  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  72.29 
 
 		 167 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  58.43 
 
 		 169 aa  210  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  56.55 
 
 		 174 aa  208  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  53.61 
 
 		 169 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  53.01 
 
 		 169 aa  198  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  55.36 
 
 		 169 aa  195  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  51.81 
 
 		 176 aa  193  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  49.4 
 
 		 174 aa  180  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  51.2 
 
 		 180 aa  173  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  45.83 
 
 		 172 aa  168  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  48.8 
 
 		 208 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  46.95 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  50.96 
 
 		 210 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  46.34 
 
 		 177 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  45.88 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  44.05 
 
 		 175 aa  162  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  50 
 
 		 212 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  42.86 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  45.62 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  43.45 
 
 		 175 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  43.9 
 
 		 185 aa  147  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  46.31 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  41.57 
 
 		 171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  44.31 
 
 		 198 aa  137  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  42.51 
 
 		 179 aa  134  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  38.22 
 
 		 186 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  46.62 
 
 		 178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  37.74 
 
 		 196 aa  107  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  33.93 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  31.87 
 
 		 197 aa  97.4  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  31.87 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  31.61 
 
 		 163 aa  90.9  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  33.74 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  33.71 
 
 		 198 aa  88.6  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  34.13 
 
 		 180 aa  84.7  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  40.65 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  30.83 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  32.72 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  30.23 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  29.07 
 
 		 191 aa  72  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  28.07 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  27.88 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  29.17 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  27.63 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  27.07 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  40.45 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  28.8 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  27.2 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  31.69 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  31.53 
 
 		 187 aa  44.7  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  25.6 
 
 		 160 aa  44.7  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  39.71 
 
 		 171 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  28.99 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1445  hypothetical protein  34.09 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4460  hypothetical protein  24.26 
 
 		 192 aa  42  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  26.32 
 
 		 191 aa  40.8  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>