54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1627 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1627  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  379  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000924391  normal  0.186435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2522  hypothetical protein  75.71 
 
 		 179 aa  292  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.596229  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2415  hypothetical protein  75.14 
 
 		 179 aa  290  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.673713  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1727  hypothetical protein  75.14 
 
 		 179 aa  289  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1944  hypothetical protein  74.58 
 
 		 179 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2292  hypothetical protein  75.14 
 
 		 179 aa  288  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.407638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1806  hypothetical protein  75.14 
 
 		 179 aa  288  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2404  hypothetical protein  74.58 
 
 		 179 aa  286  8e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2836  hypothetical protein  72.47 
 
 		 179 aa  286  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00136132  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2251  hypothetical protein  75.14 
 
 		 179 aa  285  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1540  hypothetical protein  72.32 
 
 		 179 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1808  hypothetical protein  72.47 
 
 		 179 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0130778  normal  0.0374625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2169  hypothetical protein  72.88 
 
 		 185 aa  278  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1327  hypothetical protein  69.32 
 
 		 180 aa  276  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003998  putative esterase  65.54 
 
 		 179 aa  257  7e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1310  hypothetical protein  61.67 
 
 		 183 aa  256  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1482  hypothetical protein  64.41 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.296836  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01524  hypothetical protein  63.84 
 
 		 179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1309  hypothetical protein  65.54 
 
 		 180 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000362395 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1324  hypothetical protein  65.54 
 
 		 180 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  hitchhiker  0.000007708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1975  hypothetical protein  65.54 
 
 		 180 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.82161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2793  hypothetical protein  62.71 
 
 		 180 aa  247  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1623  hypothetical protein  65.54 
 
 		 180 aa  247  7e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1286  hypothetical protein  64.97 
 
 		 180 aa  246  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2159  hypothetical protein  64.97 
 
 		 180 aa  246  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000680398 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1593  hypothetical protein  63.28 
 
 		 180 aa  246  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2487  hypothetical protein  62.71 
 
 		 180 aa  246  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2819  hypothetical protein  63.28 
 
 		 180 aa  246  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.524505 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1701  hypothetical protein  63.28 
 
 		 180 aa  246  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1925  hypothetical protein  63.84 
 
 		 180 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.389564  hitchhiker  0.0000253614 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1638  hypothetical protein  62.15 
 
 		 180 aa  244  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2215  hypothetical protein  63.84 
 
 		 180 aa  241  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.481458  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2539  protein of unknown function UPF0227  63.84 
 
 		 180 aa  241  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0228529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01112  hypothetical protein  63.84 
 
 		 180 aa  241  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1488  hypothetical protein  63.84 
 
 		 180 aa  241  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123276 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2018  hypothetical protein  63.84 
 
 		 180 aa  241  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129824 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2493  hypothetical protein  63.84 
 
 		 180 aa  241  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.717674  hitchhiker  0.000000248387 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01104  hypothetical protein  63.84 
 
 		 180 aa  241  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1230  hypothetical protein  63.84 
 
 		 180 aa  241  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00205338  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1231  hypothetical protein  63.84 
 
 		 180 aa  241  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1607  hypothetical protein  59.22 
 
 		 186 aa  239  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170858  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1986  hypothetical protein  59.78 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.997214  normal  0.536301 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0037  protein of unknown function UPF0227  25.67 
 
 		 190 aa  51.2  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4792  hypothetical protein  32.08 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.528676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4916  hypothetical protein  32.08 
 
 		 247 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4969  hypothetical protein  31.13 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5697  hypothetical protein  27.14 
 
 		 206 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2671  esterase YqiA  30.36 
 
 		 194 aa  44.3  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3044  hypothetical protein  26.8 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.93923 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43490  hypothetical protein  26.8 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0605  hypothetical protein  33.03 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65670  hypothetical protein  29.36 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0548  hypothetical protein  28.3 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.728764 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4708  hypothetical protein  31.48 
 
 		 202 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.731095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>