23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1340 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1340  FlgN family protein  100 
 
 		 141 aa  279  9e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1592  FlgN family protein  63.12 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.89295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3092  FlgN family protein  62.41 
 
 		 141 aa  164  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1335  FlgN family protein  58.87 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301574  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3105  FlgN family protein  58.87 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1411  FlgN family protein  58.87 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2967  FlgN family protein  58.87 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2952  FlgN family protein  58.87 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.409825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2602  FlgN family protein  57.45 
 
 		 141 aa  150  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.813191  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3255  flagellar biosynthetic protein FlgN  53.9 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1324  FlgN family protein  54.61 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1254  FlgN family protein  54.61 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1316  FlgN family protein  53.9 
 
 		 141 aa  135  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1156  FlgN family protein  54.81 
 
 		 157 aa  129  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1298  FlgN  51.06 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2323  flagellar biosynthetic protein FlgN  54.05 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.697168  normal  0.220477 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01279  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway chaperone  29.08 
 
 		 141 aa  76.6  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004178  flagellar biosynthesis protein FlgN  27.66 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1797  hypothetical protein  30.5 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2343  polar flagellar FlgN, putative chaperone  29.71 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.312185  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1471  putative flagellar protein FlgN  33.33 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02935  putative flagellar protein FlgN  27.46 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493772  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3105  FlgN  25.58 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>