17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1071 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1071  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  216  7e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1262  hypothetical protein  46.85 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230441 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1365  hypothetical protein  52.25 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2830  hypothetical protein  51.35 
 
 		 111 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.616543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3009  hypothetical protein  51.35 
 
 		 111 aa  104  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2912  hypothetical protein  52.25 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1167  hypothetical protein  54.05 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1176  hypothetical protein  51.35 
 
 		 111 aa  104  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1218  hypothetical protein  52.25 
 
 		 111 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3095  hypothetical protein  52.25 
 
 		 111 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.038994 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1295  hypothetical protein  52.25 
 
 		 111 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1262  hypothetical protein  52.25 
 
 		 111 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1057  hypothetical protein  43.75 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.455459  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2748  hypothetical protein  41.82 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2914  hypothetical protein  45.54 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0897  hypothetical protein  44.44 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.787189 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  28.45 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>