16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1023 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1023  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  332  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1213  hypothetical protein  71.79 
 
 		 158 aa  246  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1111  hypothetical protein  71.79 
 
 		 159 aa  245  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2960  hypothetical protein  68.83 
 
 		 163 aa  236  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.373099  hitchhiker  0.00896796 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1172  hypothetical protein  69.48 
 
 		 163 aa  235  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0188843  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0997  hypothetical protein  69.03 
 
 		 159 aa  235  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1249  hypothetical protein  68.83 
 
 		 163 aa  234  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3141  hypothetical protein  68.83 
 
 		 163 aa  234  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3056  hypothetical protein  67.53 
 
 		 163 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469706  normal  0.0518674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1130  hypothetical protein  68.46 
 
 		 153 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.165556  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1216  hypothetical protein  68.18 
 
 		 163 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.445968  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1318  hypothetical protein  67.53 
 
 		 163 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2878  hypothetical protein  67.53 
 
 		 163 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00543287  hitchhiker  0.000193701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0851  hypothetical protein  67.31 
 
 		 157 aa  230  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.403973 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2805  hypothetical protein  60.9 
 
 		 157 aa  207  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2970  hypothetical protein  56.96 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>