51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0290 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0290  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  100 
 
 		 89 aa  184  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4164  acetolactate synthase small subunit  65.82 
 
 		 86 aa  107  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3613  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  58.62 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0363  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  67.57 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3663  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  67.57 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0357  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  67.57 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4127  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  64.86 
 
 		 85 aa  103  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4008  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  64.86 
 
 		 85 aa  103  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4030  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  64.86 
 
 		 85 aa  103  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3933  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  64.86 
 
 		 85 aa  103  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4346  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  67.57 
 
 		 86 aa  103  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0423  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  58.97 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0346  amino acid-binding ACT domain-containing protein  56.41 
 
 		 88 aa  96.7  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.550945  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0443  amino acid-binding ACT domain-containing protein  60.56 
 
 		 84 aa  88.6  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.886591 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3413  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  55.26 
 
 		 93 aa  85.5  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0483  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  45.21 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.242348 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0155  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  45.21 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4060  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  45.21 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0139  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  43.06 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4759  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  43.24 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4031  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  47.76 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.612763  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4220  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  46.27 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3775  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  41.67 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4233  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50.88 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.196128  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4135  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50.88 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.683239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4151  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50.88 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5203  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50.88 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03596  hypothetical protein  50.88 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0138992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4207  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50.88 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4280  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50.88 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3986  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50.88 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03647  acetolactate synthase II, small subunit  50.88 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0148  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  49.25 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4014  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  37.04 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124044 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4184  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  44.29 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4233  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  44.29 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.594626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4112  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  44.29 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4127  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  44.29 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4292  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  44.29 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3280  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  57.3 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0347  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.71 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0054  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  37.5 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4844  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  36.36 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00411  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  31.76 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002040  acetolactate synthase small subunit  34.21 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2489  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  34.62 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.33 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2115  hypothetical protein  34.57 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4448  acetolactate synthase, small subunit  33.33 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  32.14 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  32.91 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>