23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0230 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0306  hypothetical protein  62.06 
 
 		 503 aa  676    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3984  hypothetical protein  60.88 
 
 		 548 aa  712    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0379  hypothetical protein  67.96 
 
 		 543 aa  767    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4180  hypothetical protein  60.53 
 
 		 548 aa  706    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0276  hypothetical protein  63.26 
 
 		 561 aa  739    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4221  hypothetical protein  67.37 
 
 		 517 aa  756    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.256943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4062  hypothetical protein  61.24 
 
 		 548 aa  712    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3685  hypothetical protein  56.49 
 
 		 549 aa  671    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0230  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1179    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.769697  normal  0.583487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4093  hypothetical protein  60.53 
 
 		 548 aa  709    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245434  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3352  hypothetical protein  59.86 
 
 		 546 aa  684    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3877  hypothetical protein  58.25 
 
 		 546 aa  688    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.413132  normal  0.0515255 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0393  hypothetical protein  59.17 
 
 		 559 aa  680    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0272  hypothetical protein  59.18 
 
 		 546 aa  689    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3673  hypothetical protein  59.71 
 
 		 546 aa  693    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3442  hypothetical protein  57.58 
 
 		 550 aa  672    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.325746  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0927  hypothetical protein  34.55 
 
 		 608 aa  303  5.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.943956  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0256  hypothetical protein  29.29 
 
 		 560 aa  208  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.17253  normal  0.370888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0286  hypothetical protein  26.32 
 
 		 546 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399443  hitchhiker  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2958  hypothetical protein  24.87 
 
 		 609 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.725385  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0364  hypothetical protein  28.7 
 
 		 683 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1656  hypothetical protein  29.05 
 
 		 627 aa  52  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.558221  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2475  hypothetical protein  28.78 
 
 		 611 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.641856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>