23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25270 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_25270  soluble P-type ATPase  100 
 
 
154 aa  314  3e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0968329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1711  hypothetical protein  42.21 
 
 
155 aa  124  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000195986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0830  soluble P-type ATPase  45.33 
 
 
156 aa  123  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1112  hypothetical protein  44.37 
 
 
156 aa  123  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00144751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2299  hypothetical protein  43.23 
 
 
156 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0021594  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0027  hypothetical protein  39.61 
 
 
156 aa  120  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1184  hypothetical protein  41.4 
 
 
156 aa  120  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0282  hypothetical protein  44.16 
 
 
156 aa  120  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1236  hypothetical protein  42.21 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2830  HAD family hydrolase  40.91 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0593  hypothetical protein  45.39 
 
 
158 aa  117  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1047  hypothetical protein  41.56 
 
 
156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1180  hypothetical protein  44.81 
 
 
156 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.944923 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0477  HAD family hydrolase  36.42 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0341937  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1135  hypothetical protein  42 
 
 
155 aa  103  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0725  HAD family hydrolase  35.1 
 
 
149 aa  103  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1442  HAD family hydrolase  37.59 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0360  hypothetical protein  36.92 
 
 
127 aa  87.8  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.171021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0424  hypothetical protein  38.41 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0545  HAD family hydrolase  35.34 
 
 
114 aa  72  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0908352  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  33.05 
 
 
799 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  33.9 
 
 
799 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  28.81 
 
 
734 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>