47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21530 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21530  uncharacterized membrane protein  100 
 
 		 408 aa  811    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.198401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25260  uncharacterized membrane protein  33.93 
 
 		 381 aa  239  5e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.461148  normal  0.040821 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0081  hypothetical protein  30.16 
 
 		 367 aa  178  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00405626  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1518  hypothetical protein  28.83 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.913415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0308  hypothetical protein  25.71 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0692  hypothetical protein  24.8 
 
 		 355 aa  116  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0235088  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0677  hypothetical protein  24.8 
 
 		 355 aa  116  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.202663  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2248  hypothetical protein  25.41 
 
 		 354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.284315  normal  0.730008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1879  hypothetical protein  25.07 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3490  hypothetical protein  25.14 
 
 		 354 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0707746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0167  hypothetical protein  27.18 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.604308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2232  hypothetical protein  28.61 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1876  hypothetical protein  25.45 
 
 		 385 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0643  hypothetical protein  25.13 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0857  hypothetical protein  28.53 
 
 		 354 aa  101  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.549671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2010  hypothetical protein  25.07 
 
 		 355 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2540  hypothetical protein  22.04 
 
 		 359 aa  93.6  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2592  hypothetical protein  22.04 
 
 		 359 aa  93.6  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0471  hypothetical protein  24.69 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2079  hypothetical protein  23.71 
 
 		 349 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05130  uncharacterized membrane protein  25.22 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2221  hypothetical protein  23.91 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3313  hypothetical protein  26.61 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4359  hypothetical protein  24.19 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12490  uncharacterized membrane protein  24.51 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07920  uncharacterized membrane protein  23.53 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2884  hypothetical protein  20.73 
 
 		 352 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1874  hypothetical protein  22.61 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163445  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2565  hypothetical protein  20.11 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2507  transporter  26.59 
 
 		 341 aa  57  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517711 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2562  hypothetical protein  22.07 
 
 		 346 aa  57  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2710  hypothetical protein  26.67 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2014  hypothetical protein  25.15 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.85804  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3295  hypothetical protein  22.29 
 
 		 346 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.335957 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2091  hypothetical protein  22.61 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.295909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2046  hypothetical protein  22.29 
 
 		 346 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00084703 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1824  hypothetical protein  22.29 
 
 		 346 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2125  hypothetical protein  22.29 
 
 		 346 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.586239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2012  hypothetical protein  22.29 
 
 		 346 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1840  hypothetical protein  22.29 
 
 		 346 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.406982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1870  hypothetical protein  22.29 
 
 		 346 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416915  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1661  hypothetical protein  23.87 
 
 		 348 aa  53.5  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1765  hypothetical protein  28.57 
 
 		 346 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1519  hypothetical protein  21.66 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0891  hypothetical protein  24.7 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4945  hypothetical protein  23.08 
 
 		 343 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000030592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0299  hypothetical protein  22.42 
 
 		 356 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>