19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06980 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06980  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  734    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.316809  normal  0.0886062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3964  hypothetical protein  30.37 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4265  hypothetical protein  26.79 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.045316  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1373  hypothetical protein  42.35 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5001  hypothetical protein  41.46 
 
 		 238 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4381  hypothetical protein  34.74 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1376  hypothetical protein  39.02 
 
 		 209 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1096  hypothetical protein  38.55 
 
 		 217 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434425  normal  0.267536 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1107  hypothetical protein  38.55 
 
 		 217 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1080  hypothetical protein  38.55 
 
 		 217 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3495  hypothetical protein  34.57 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.969795  normal  0.604812 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21410  hypothetical protein  34.18 
 
 		 240 aa  53.9  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787281  normal  0.739491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1110  hypothetical protein  34.15 
 
 		 225 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1099  hypothetical protein  34.15 
 
 		 225 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1082  hypothetical protein  34.15 
 
 		 225 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00353882  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1053  hypothetical protein  28.12 
 
 		 234 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.876186  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4772  hypothetical protein  22.22 
 
 		 205 aa  50.1  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.880789  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3915  hypothetical protein  33.75 
 
 		 185 aa  49.7  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.366535  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5326  hypothetical protein  32.56 
 
 		 224 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>