13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3886 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3886  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  213  7e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3952  hypothetical protein  90 
 
 		 101 aa  191  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4067  hypothetical protein  90 
 
 		 101 aa  191  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3767  hypothetical protein  88.12 
 
 		 101 aa  191  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3859  hypothetical protein  89 
 
 		 101 aa  190  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0098  hypothetical protein  91 
 
 		 101 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4302  hypothetical protein  91 
 
 		 101 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4442  hypothetical protein  91 
 
 		 101 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.915178 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4247  hypothetical protein  91 
 
 		 101 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1942  hypothetical protein  38.78 
 
 		 100 aa  87.4  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00191873  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00105  hypothetical protein  38.78 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3247  hypothetical protein  33.67 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.811375  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0203  hypothetical protein  23.6 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>