14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3338 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3338  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  190  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3231  hypothetical protein  55.38 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.535539  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3910  hypothetical protein  42.47 
 
 		 97 aa  62  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3242  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0685138  hitchhiker  0.00000836292 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0747  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0954264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0719  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000186063  hitchhiker  0.0012701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0775  hypothetical protein  42.68 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.180776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0807  hypothetical protein  42.68 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.478599  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0800  hypothetical protein  42.68 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.912627  hitchhiker  0.000000276199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3584  hypothetical protein  41.46 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.072735  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0537  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109009  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0762  hypothetical protein  34.07 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204389  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0767  hypothetical protein  39.13 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3569  hypothetical protein  31.52 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.562793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>