22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1156 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1156  FlgN family protein  100 
 
 		 157 aa  309  7.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1298  FlgN  61.87 
 
 		 141 aa  163  8e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1254  FlgN family protein  57.55 
 
 		 141 aa  158  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1324  FlgN family protein  57.55 
 
 		 141 aa  158  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3105  FlgN family protein  59.71 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1411  FlgN family protein  59.71 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2952  FlgN family protein  59.71 
 
 		 141 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.409825  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2967  FlgN family protein  59.71 
 
 		 141 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1316  FlgN family protein  56.83 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3255  flagellar biosynthetic protein FlgN  58.27 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2602  FlgN family protein  57.55 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.813191  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1335  FlgN family protein  56.52 
 
 		 141 aa  147  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3092  FlgN family protein  51.8 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1592  FlgN family protein  55.4 
 
 		 141 aa  137  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.89295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1340  FlgN family protein  54.81 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2323  flagellar biosynthetic protein FlgN  53.28 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.697168  normal  0.220477 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01279  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway chaperone  33.87 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004178  flagellar biosynthesis protein FlgN  32.26 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2343  polar flagellar FlgN, putative chaperone  28.26 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.312185  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1797  hypothetical protein  30.4 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1471  putative flagellar protein FlgN  29.55 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02935  putative flagellar protein FlgN  29.93 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>