23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1009 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1225  hypothetical protein  60.15 
 
 		 792 aa  994    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1147  type IV pilus assembly PilZ  61.19 
 
 		 793 aa  1009    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3541  type IV pilus assembly PilZ  56.44 
 
 		 805 aa  938    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0300151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3359  type IV pilus assembly PilZ  61.06 
 
 		 793 aa  1008    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3033  type IV pilus assembly PilZ  53.72 
 
 		 805 aa  909    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3371  type IV pilus assembly PilZ  58.84 
 
 		 804 aa  968    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3221  type IV pilus assembly PilZ  61.06 
 
 		 793 aa  1008    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2815  type IV pilus assembly PilZ  61.99 
 
 		 795 aa  1015    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2808  type IV pilus assembly PilZ  53.79 
 
 		 796 aa  893    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000659651 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3220  type IV pilus assembly PilZ  62.07 
 
 		 804 aa  1019    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0980  hypothetical protein  57.72 
 
 		 792 aa  942    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.218662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1048  type IV pilus assembly PilZ  62.03 
 
 		 790 aa  1020    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.023963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1009  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 794 aa  1642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1109  type IV pilus assembly PilZ  62.03 
 
 		 790 aa  1020    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.618893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1044  type IV pilus assembly PilZ  62.15 
 
 		 790 aa  1023    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.713733  hitchhiker  0.00851048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1034  type IV pilus assembly PilZ  56.57 
 
 		 796 aa  934    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1279  type IV pilus assembly PilZ  28.55 
 
 		 840 aa  332  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02992  type IV pilus assembly PilZ  28.54 
 
 		 841 aa  318  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.488872  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03371  hypothetical protein  26.2 
 
 		 782 aa  247  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1106  hypothetical protein  26.72 
 
 		 822 aa  247  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002635  hypothetical protein  25.28 
 
 		 782 aa  235  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.729255  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0625  hypothetical protein  25.09 
 
 		 781 aa  226  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.432521  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1923  hypothetical protein  25.19 
 
 		 779 aa  213  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.453342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>