18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0905 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0905  putative lipoprotein  100 
 
 		 152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4061  putative lipoprotein  75 
 
 		 155 aa  223  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0968  putative lipoprotein  76.16 
 
 		 152 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3391  putative lipoprotein  73.86 
 
 		 150 aa  196  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0976  putative lipoprotein  68.87 
 
 		 150 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1062  putative lipoprotein  74.17 
 
 		 150 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3295  putative lipoprotein  74.17 
 
 		 150 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3516  putative lipoprotein  74.17 
 
 		 150 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.699478 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0972  putative lipoprotein  69.54 
 
 		 150 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1010  putative lipoprotein  69.54 
 
 		 150 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3407  putative lipoprotein  56.21 
 
 		 157 aa  164  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2209  hypothetical protein  46.43 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2181  hypothetical protein  46.43 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4399  hypothetical protein  52.94 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.95537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2832  hypothetical protein  50.82 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2221  hypothetical protein  55.56 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.700232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3695  hypothetical protein  51.67 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0221035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3399  hypothetical protein  46.67 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0815274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>