20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0408 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0408  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  204  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.392247  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0283  hypothetical protein  64.95 
 
 		 106 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000469346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0309  hypothetical protein  65.62 
 
 		 98 aa  137  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4062  hypothetical protein  61.22 
 
 		 110 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.129489  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3960  hypothetical protein  60.61 
 
 		 110 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4155  hypothetical protein  60.61 
 
 		 110 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4037  hypothetical protein  60.61 
 
 		 110 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0331  hypothetical protein  60.82 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3840  hypothetical protein  59.79 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3644  hypothetical protein  59.79 
 
 		 101 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.375921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0300  hypothetical protein  59.79 
 
 		 101 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3658  hypothetical protein  62.64 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3323  hypothetical protein  54.08 
 
 		 102 aa  122  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0047643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4195  hypothetical protein  58.76 
 
 		 97 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.10678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0398  hypothetical protein  60.22 
 
 		 97 aa  121  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.980597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0263  hypothetical protein  53.61 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151206  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00343  hypothetical protein  35 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002093  aminopeptidase N  35 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2577  hypothetical protein  39.51 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00169793  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0225  hypothetical protein  35.62 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>