21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4480 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4480  phage protein GP46  100 
 
 		 137 aa  278  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2249  phage protein GP46  100 
 
 		 137 aa  278  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.213906 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2252  phage protein GP46  98.54 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2585  phage GP46 family protein  51.88 
 
 		 141 aa  140  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3861  phage FluMu protein gp46  48.36 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1161  Phage FluMu protein gp46  50 
 
 		 132 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4588  Phage GP46  48.28 
 
 		 132 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1871  GP46 family protein  44.26 
 
 		 405 aa  87  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.881976  hitchhiker  0.000000000000640584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3048  putative bacteriophage protein GP46, Mu-like  44.86 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3734  phage GP46  40.65 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2734  phage protein GP46  38.89 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.86914  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2085  phage protein GP46  40.16 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1472  phage protein GP46  38.1 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2812  GP46 family protein  38.1 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1045  phage protein GP46  36.76 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3114  GP46 family protein  35.96 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2701  hypothetical protein  37.7 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0742  phage protein GP46  36.07 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0695  phage protein GP46  36.07 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6584  putative bacteriophage protein, GP46-like protein  26.9 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4483  GP46 family protein  33.33 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.185083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>