19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3688 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3688  PilN family protein  100 
 
 		 179 aa  352  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.483537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3860  PilN family protein  98.88 
 
 		 179 aa  348  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.793457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3797  PilN family protein  98.88 
 
 		 179 aa  348  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.416536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3763  PilN family protein  98.32 
 
 		 179 aa  347  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3690  PilN family protein  98.32 
 
 		 179 aa  346  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.794853  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0319  Fimbrial assembly family protein  48.04 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0816995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03198  hypothetical protein  48.04 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0290393  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3771  PilN family protein  48.04 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3865  PilN family protein  48.04 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0528585  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03246  predicted fimbrial assembly protein  48.04 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0184344  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3671  PilN family protein  48.6 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000206166  normal  0.11524 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0319  fimbrial assembly family protein  48.04 
 
 		 179 aa  124  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139922  normal  0.0971984 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3589  PilN family protein  48.04 
 
 		 179 aa  124  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00572766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4699  PilN family protein  48.04 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0166356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3807  fimbrial assembly family protein  35.71 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00514  type IV pilus biogenesis protein PilN  29.75 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0256  Fimbrial assembly family protein  25.73 
 
 		 186 aa  42  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0342405  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1515  fimbrial assembly family protein  26.75 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1590  fimbrial assembly family protein  30.59 
 
 		 355 aa  40.8  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.493789  normal  0.437646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>