15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3160 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3143  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3323  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0403449 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3160  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.764419  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3223  hypothetical protein  98.78 
 
 
106 aa  170  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  0.0263221 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3209  hypothetical protein  98.78 
 
 
106 aa  170  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.13365 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02671  hypothetical protein  69.51 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.561145  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0868  prepilin peptidase-dependent protein C  69.51 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2969  hypothetical protein  69.51 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0892  hypothetical protein  69.51 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02632  hypothetical protein  69.51 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.510371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2970  hypothetical protein  68.29 
 
 
115 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.254629  normal  0.0125225 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3039  hypothetical protein  68.29 
 
 
107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4088  hypothetical protein  68.29 
 
 
107 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.198399  normal  0.676509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3143  hypothetical protein  68.35 
 
 
107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0860525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3266  hypothetical protein  60 
 
 
107 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334582  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>