18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2924 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2924  Mig-14  100 
 
 		 298 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2893  Mig-14  97.99 
 
 		 298 aa  614  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2977  hypothetical protein  97.99 
 
 		 298 aa  614  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3080  Mig-14  97.65 
 
 		 298 aa  610  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2958  hypothetical protein  96.98 
 
 		 298 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127053  hitchhiker  0.0000324409 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0097  Mig-14 family protein  56.67 
 
 		 302 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028214  hitchhiker  0.0000000164486 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1493  Mig-14 family protein  41.58 
 
 		 296 aa  258  9e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.66727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0475  Mig-14  27.72 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.496349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4814  Mig-14 family protein  26.83 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4942  Mig-14 family protein  26.48 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4991  Mig-14 family protein  26.48 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0526  Mig-14 family protein  26.13 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254564  normal  0.164159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4990  hypothetical protein  25.96 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66150  hypothetical protein  26.13 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5738  hypothetical protein  26.13 
 
 		 298 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0530  Mig-14  25.61 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0825509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0595  Mig-14 family protein  23.78 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44700  Mig-14 family protein  23.24 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.390095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>