21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2008 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2008  putative fimbriae; usher  100 
 
 		 174 aa  345  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.446551  normal  0.112656 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0368  putative fimbrial usher  90.74 
 
 		 441 aa  300  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.584072 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0430  putative fimbrial usher  90.74 
 
 		 441 aa  300  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.278902  hitchhiker  0.000289263 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0377  putative fimbrial usher  90.74 
 
 		 441 aa  300  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.898506  normal  0.223329 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0370  putative fimbrial usher  90.12 
 
 		 441 aa  298  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0390  putative fimbrial usher  90.12 
 
 		 441 aa  298  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.097978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37010  fimbrial subunit CupA4  38.69 
 
 		 453 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3020  fimbrial subunit  39.05 
 
 		 448 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0168  hypothetical protein  39.76 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0500  hypothetical protein  40.12 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.5659  decreased coverage  0.000668779 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4045  hypothetical protein  40.12 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.246264  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1664  hypothetical protein  35.26 
 
 		 475 aa  69.7  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.393948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2830  hypothetical protein  34.94 
 
 		 474 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59750  fimbrial subunit  30.12 
 
 		 448 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000000000000441836  hitchhiker  2.5403100000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1273  putative outer membrane protein  33.73 
 
 		 394 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0297  fimbrial subunit  30.92 
 
 		 447 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0295  hypothetical protein  31.65 
 
 		 457 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2275  hypothetical protein  29.59 
 
 		 449 aa  47.4  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0256688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2107  hypothetical protein  29.59 
 
 		 425 aa  47.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2166  hypothetical protein  29.59 
 
 		 425 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0114121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0301  fimbrial subunit  33.62 
 
 		 456 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>