11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0687 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0687  protein gp55  100 
 
 		 178 aa  353  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1435  hypothetical protein  87.43 
 
 		 177 aa  283  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal  0.312152 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2082  hypothetical protein  87.43 
 
 		 177 aa  283  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2091  protein GP55  70.44 
 
 		 165 aa  217  7.999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0071372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2084  phage-tail assembly-like protein  70 
 
 		 160 aa  216  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1643  hypothetical protein  71.43 
 
 		 165 aa  215  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000036916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1097  hypothetical protein  33.52 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926536 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4458  protein gp55  32.78 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000235907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2094  hypothetical protein  32.54 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217018  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4036  hypothetical protein  32.68 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2766  hypothetical protein  31.91 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.0232979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>