14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_A0013 on replicon NC_011081
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011081  SeHA_A0013  YafB  100 
 
 		 200 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.084758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0146  hypothetical protein  68.88 
 
 		 205 aa  270  9e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1033  hypothetical protein  31.09 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0842196 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3812  activator of osmoprotectant transporter  40.79 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31951  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0862  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  33.75 
 
 		 295 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2099  putative solute/DNA competence effector  30.63 
 
 		 232 aa  41.6  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000516503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1811  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  30.63 
 
 		 232 aa  41.2  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.179036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2060  putative solute/DNA competence effector  30.63 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01802  putative solute/DNA competence effector  30.63 
 
 		 232 aa  41.2  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1922  putative solute/DNA competence effector  30.63 
 
 		 232 aa  41.2  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.31825e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1801  putative solute/DNA competence effector  30.63 
 
 		 232 aa  41.2  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.304179  normal  0.0872497 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1356  putative solute/DNA competence effector  30.63 
 
 		 232 aa  41.2  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120043  normal  0.2491 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2564  putative solute/DNA competence effector  30.63 
 
 		 232 aa  41.2  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000584376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01790  hypothetical protein  30.63 
 
 		 232 aa  41.2  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>