16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4034 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4034  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.567121  normal  0.624803 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3974  hypothetical protein  99.44 
 
 		 179 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3846  hypothetical protein  98.88 
 
 		 179 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.339156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3865  hypothetical protein  99.44 
 
 		 179 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3930  hypothetical protein  97.77 
 
 		 179 aa  340  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0831  hypothetical protein  70.35 
 
 		 184 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1063  hypothetical protein  67.05 
 
 		 185 aa  251  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0672  hypothetical protein  67.72 
 
 		 195 aa  234  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0742  hypothetical protein  65.82 
 
 		 195 aa  230  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2448  hypothetical protein  46.05 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.344552  decreased coverage  0.0000000304811 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0361  hypothetical protein  40 
 
 		 182 aa  134  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23390  hypothetical protein  39.77 
 
 		 205 aa  128  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0020  hypothetical protein  43.04 
 
 		 227 aa  120  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.425682 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31380  hypothetical protein  35.12 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4292  hypothetical protein  35.59 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495485  normal  0.900543 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0254  hypothetical protein  33.05 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>