17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1097 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1097  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926536 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4458  protein gp55  96.11 
 
 		 180 aa  300  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000235907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2082  hypothetical protein  34.41 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0687  protein gp55  34.97 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1435  hypothetical protein  33.87 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal  0.312152 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1643  hypothetical protein  30.63 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000036916  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2091  protein GP55  30.06 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0071372  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2094  hypothetical protein  30 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2084  phage-tail assembly-like protein  30.38 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3387  hypothetical protein  32.61 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826863  hitchhiker  0.000958811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3932  hypothetical protein  29.76 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.751475  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3887  hypothetical protein  40.87 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196471  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4036  hypothetical protein  32.93 
 
 		 159 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1067  gp23  57.89 
 
 		 193 aa  45.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1795  hypothetical protein  43.36 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2419  hypothetical protein  33.89 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2766  hypothetical protein  29.79 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.0232979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>