19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0968 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0968  putative lipoprotein  100 
 
 
152 aa  298  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4061  putative lipoprotein  69.68 
 
 
155 aa  216  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0905  putative lipoprotein  76.16 
 
 
152 aa  205  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1062  putative lipoprotein  77.92 
 
 
150 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3295  putative lipoprotein  77.92 
 
 
150 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3516  putative lipoprotein  77.92 
 
 
150 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.699478 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0976  putative lipoprotein  72.37 
 
 
150 aa  202  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3391  putative lipoprotein  78.81 
 
 
150 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0972  putative lipoprotein  73.03 
 
 
150 aa  199  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1010  putative lipoprotein  73.03 
 
 
150 aa  199  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3407  putative lipoprotein  56.05 
 
 
157 aa  176  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2209  hypothetical protein  48.35 
 
 
83 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2181  hypothetical protein  48.35 
 
 
83 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2832  hypothetical protein  52.38 
 
 
85 aa  60.5  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3695  hypothetical protein  57.14 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0221035 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4399  hypothetical protein  46.3 
 
 
91 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.95537  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2221  hypothetical protein  43.08 
 
 
86 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.700232  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3132  hypothetical protein  39.71 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3399  hypothetical protein  46.67 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0815274  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>