15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0275 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0275  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  330  6e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000890841  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1089  hypothetical protein  54.94 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.429336  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3197  hypothetical protein  56.21 
 
 		 170 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.367183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1193  hypothetical protein  55.56 
 
 		 170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1102  hypothetical protein  54.9 
 
 		 170 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1262  hypothetical protein  52.47 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3005  hypothetical protein  51.23 
 
 		 170 aa  174  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1161  hypothetical protein  58.27 
 
 		 170 aa  174  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2923  hypothetical protein  50.62 
 
 		 170 aa  174  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3102  hypothetical protein  52.29 
 
 		 170 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02213  hypothetical protein  39.22 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0542  hypothetical protein  26.97 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3908  hypothetical protein  22.08 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3642  hypothetical protein  24.2 
 
 		 181 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1577  hypothetical protein  20.69 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>