24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2048 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2048  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 168 aa  344  3e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.045391  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2046  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  37.89 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000946986  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  29.87 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0115  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0287107  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  26.5 
 
 		 225 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1679  protein of unknown function DUF1007  26.5 
 
 		 225 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355728  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1399  protein of unknown function DUF1007  26.72 
 
 		 219 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0330358  normal  0.0597647 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3679  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  33.75 
 
 		 222 aa  51.6  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.928215  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4269  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.32 
 
 		 224 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.655735 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1479  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2774  hypothetical protein  23.84 
 
 		 214 aa  45.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3392  protein of unknown function DUF1007  27.62 
 
 		 213 aa  44.7  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0941  protein of unknown function DUF1007  28 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049615  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0097  hypothetical protein  26.53 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0082  hypothetical protein  23.88 
 
 		 243 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0089  hypothetical protein  26.53 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2712  hypothetical protein  23.87 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3809  hypothetical protein  32.43 
 
 		 219 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0859  hypothetical protein  26.62 
 
 		 217 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4248  hypothetical protein  27.61 
 
 		 231 aa  42  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5736  protein of unknown function DUF1007  23.88 
 
 		 221 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0285  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  27.08 
 
 		 187 aa  41.6  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.396844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2375  protein of unknown function DUF1007  18.27 
 
 		 221 aa  41.2  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18361 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1233  protein of unknown function DUF1007  25.86 
 
 		 202 aa  40.8  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>