29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2046 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2046  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 169 aa  344  3e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000946986  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2048  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  37.89 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.045391  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3809  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3679  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  33.96 
 
 		 222 aa  67.4  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.928215  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  27.61 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3392  protein of unknown function DUF1007  25 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1754  hypothetical protein  25.17 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2774  hypothetical protein  23.65 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4248  hypothetical protein  27.34 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0082  hypothetical protein  24.36 
 
 		 243 aa  51.2  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2203  hypothetical protein  23.88 
 
 		 224 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0980814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  23.97 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1679  protein of unknown function DUF1007  23.97 
 
 		 225 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355728  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2712  hypothetical protein  27.48 
 
 		 219 aa  48.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1479  hypothetical protein  29.25 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0097  hypothetical protein  25.76 
 
 		 234 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0089  hypothetical protein  25.76 
 
 		 234 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1399  protein of unknown function DUF1007  23.88 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0330358  normal  0.0597647 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0752  protein of unknown function DUF1007  23.48 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000375765  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3691  protein of unknown function DUF1007  24.59 
 
 		 213 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5736  protein of unknown function DUF1007  24.06 
 
 		 221 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2375  protein of unknown function DUF1007  23.24 
 
 		 221 aa  44.7  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18361 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1594  polyphosphate kinase  22.36 
 
 		 433 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0115  hypothetical protein  24.81 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0287107  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1043  protein of unknown function DUF1007  24.63 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0285  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  24.65 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.396844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2332  hypothetical protein  25.76 
 
 		 209 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0375324  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4269  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  23.08 
 
 		 224 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.655735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2975  protein of unknown function DUF1007  21.38 
 
 		 223 aa  40.8  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>