77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1643 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  50.93 
 
 		 163 aa  173  9e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  31.76 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  32.93 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  37.78 
 
 		 171 aa  98.2  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  30 
 
 		 208 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  35.82 
 
 		 163 aa  95.1  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  32.69 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  30 
 
 		 177 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  34.11 
 
 		 168 aa  91.7  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  34.35 
 
 		 167 aa  91.3  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  34.81 
 
 		 169 aa  90.9  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  31.61 
 
 		 168 aa  90.9  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  29.38 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  31.08 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  30.64 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  34.15 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  34.59 
 
 		 169 aa  88.6  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  27.65 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  34.07 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  34.07 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  88.2  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  34.07 
 
 		 169 aa  88.2  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  29.53 
 
 		 210 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  29.3 
 
 		 168 aa  87  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  32.33 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  32.87 
 
 		 177 aa  84.3  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  32.12 
 
 		 186 aa  84  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  29.27 
 
 		 171 aa  84  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  27.61 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  36.15 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  26.9 
 
 		 179 aa  80.5  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  36.13 
 
 		 174 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  29.85 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  25.93 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  27.07 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  32.17 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  27.48 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  27.48 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  27.94 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  35.09 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  32.54 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  31.25 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  28.82 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  28.85 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  26.7 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  33 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  33 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  28.99 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  26.4 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  23.42 
 
 		 168 aa  47.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  33.78 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  25 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  31.25 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  30.6 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  25.78 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4460  hypothetical protein  24.59 
 
 		 192 aa  44.7  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  23.87 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  30 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  30.13 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  23.58 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  26.67 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  34.21 
 
 		 397 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  27.22 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  30.13 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  26.56 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  29.03 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  28.38 
 
 		 167 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  24.24 
 
 		 169 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  29.2 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  30.13 
 
 		 147 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  27.59 
 
 		 190 aa  42  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  27.59 
 
 		 190 aa  42  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>