55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3479 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3479  ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6  100 
 
 		 229 aa  444  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.111551  normal  0.0139812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3389  phage shock protein A, PspA  60.53 
 
 		 231 aa  257  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3822  phage shock protein A, PspA  55.46 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302506  normal  0.194258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1388  hypothetical protein  55.7 
 
 		 231 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0883629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16150  hypothetical protein  55.7 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1224  phage shock protein A, PspA  46.7 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5044  phage shock protein A, PspA  46.46 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3786  PspA/IM30 family protein  46.02 
 
 		 235 aa  181  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1693  PspA/IM30  46.02 
 
 		 235 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.509577  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0185  phage shock protein A, PspA  43.61 
 
 		 227 aa  178  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01340  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  44.49 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3482  phage shock protein A, PspA  42.11 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0916026  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3091  phage shock protein A, PspA  41.92 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0777554  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0922  phage shock protein A, PspA  41.48 
 
 		 229 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3450  phage shock protein A, PspA  41.48 
 
 		 229 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0912  phage shock protein A, PspA  41.48 
 
 		 229 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0749469  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4191  PspA/IM30 family protein  42.11 
 
 		 229 aa  167  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0888  phage shock protein A, PspA  41.48 
 
 		 229 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0755885  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0827  phage shock protein A, PspA  42.36 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0722  phage shock protein A, PspA  41.23 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000273053  hitchhiker  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3765  hypothetical protein  41.92 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0623  phage shock protein A, PspA  42.54 
 
 		 228 aa  164  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3114  phage shock protein A, PspA  41.48 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.139469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0697  PspA/IM30  41.23 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000488945  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0858  phage shock protein A, PspA  41.48 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.69065  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02185  PspA/IM30 family protein  43.56 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3838  phage shock protein A, PspA  40.35 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.867887  unclonable  0.00000000015087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1404  phage shock protein A, PspA  41.3 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.792709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2668  PspA/IM30  41.23 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3266  phage shock protein A, PspA  39.04 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.942546  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4649  PspA/IM30 family protein  39.57 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04011  hypothetical protein  37.39 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3831  phage shock protein A, PspA  37.39 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000771014 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4742  PspA/IM30 family protein  37.39 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.473518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3811  phage shock protein A, PspA  37.39 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04049  predicted transcriptional regulator effector protein  37.39 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4768  PspA/IM30 family protein  39.13 
 
 		 232 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4789  PspA/IM30 family protein  39.13 
 
 		 232 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4732  PspA/IM30 family protein  39.13 
 
 		 232 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4426  PspA/IM30 family protein  37.39 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5368  hypothetical protein  34.93 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.813565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4653  PspA/IM30 family protein  37.39 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5698  PspA/IM30 family protein  36.96 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5273  phage shock protein A, PspA  33.48 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5545  phage shock protein A, PspA  34.06 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892809 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3703  phage shock protein A, PspA  33.93 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0677  phage shock protein A, PspA  30.73 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0735  phage shock protein A, PspA  27.98 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1637  phage shock protein A, PspA  30.8 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2993  phage shock protein A, PspA  25.37 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.403474  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3183  phage shock protein A, PspA  27.44 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  0.95857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2957  PspA/IM30 family protein  26.67 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4580  phage shock protein A, PspA  28.65 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606937  normal  0.0580714 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4514  phage shock protein A, PspA  34.62 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0564095  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1604  phage shock protein A, PspA  26.98 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>