48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1973 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1973  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  473  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0305  hypothetical protein  41.55 
 
 		 193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1814  hypothetical protein  40.47 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.660387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3430  hypothetical protein  52.83 
 
 		 171 aa  131  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11280  hypothetical protein  43.8 
 
 		 172 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1036  hypothetical protein  43.8 
 
 		 172 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5028  putative lipoprotein  40.62 
 
 		 172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0505  putative lipoprotein  45.69 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0127462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0540  hypothetical protein  48.42 
 
 		 177 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71580  hypothetical protein  37.36 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3866  hypothetical protein  35.68 
 
 		 173 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06620  hypothetical protein  47.37 
 
 		 171 aa  108  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600146  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0558  lipoprotein  45.69 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  0.717571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6211  hypothetical protein  36.78 
 
 		 182 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00771  hypothetical protein  48.72 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5045  hypothetical protein  37.93 
 
 		 180 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.110017 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0425  hypothetical protein  46.15 
 
 		 161 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0550  lipoprotein  47.37 
 
 		 190 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5491  hypothetical protein  37.93 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0115  hypothetical protein  35.33 
 
 		 178 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4472  putative lipoprotein  47.37 
 
 		 174 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0680  lipoprotein, putative  47.37 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0141  hypothetical protein  36.78 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001702  hypothetical protein  45.87 
 
 		 164 aa  102  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2133  hypothetical protein  45.54 
 
 		 173 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5619  hypothetical protein  35.75 
 
 		 197 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774523  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01230  hypothetical protein  33.71 
 
 		 195 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0142  hypothetical protein  40.87 
 
 		 153 aa  99  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.143516  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5241  hypothetical protein  36.59 
 
 		 177 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98466  normal  0.106495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5333  hypothetical protein  36.59 
 
 		 189 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5382  hypothetical protein  36.59 
 
 		 177 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05705  hypothetical protein  55.88 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00217  lipoprotein, putative  51.43 
 
 		 158 aa  92.4  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1562  hypothetical protein  39.66 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0303  hypothetical protein  32.39 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.965134  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2156  hypothetical protein  38.89 
 
 		 183 aa  87.8  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.811392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1829  hypothetical protein  43.75 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2285  hypothetical protein  43.18 
 
 		 218 aa  85.5  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3492  hypothetical protein  37.4 
 
 		 214 aa  85.1  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2155  hypothetical protein  44.44 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3556  hypothetical protein  44.94 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3393  hypothetical protein  34.91 
 
 		 184 aa  78.2  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191739  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0703  hypothetical protein  40 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00895458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1843  hypothetical protein  37 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3013  hypothetical protein  32.73 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.195597  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4181  hypothetical protein  38.27 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.526119 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3621  hypothetical protein  33.98 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4728  hypothetical protein  41.54 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>