69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1040 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
148 aa  311  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  63.27 
 
 
147 aa  209  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  49.32 
 
 
148 aa  168  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  51.37 
 
 
146 aa  153  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  47.59 
 
 
147 aa  152  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  46.9 
 
 
145 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5253  hypothetical protein  44.08 
 
 
154 aa  137  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00063173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  41.38 
 
 
157 aa  118  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  37.16 
 
 
147 aa  116  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  41.26 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  38.13 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  35.66 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  31.91 
 
 
142 aa  84.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0679  hypothetical protein  34.29 
 
 
152 aa  84  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  31.72 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  31.91 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  27.34 
 
 
179 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  33.8 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  31.08 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  30.61 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  27.27 
 
 
182 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  30.66 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  28.77 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  32.5 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  32.5 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  25.9 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  31.03 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  26.67 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2943  hypothetical protein  26.19 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159813  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0928  phage tail protein  27.66 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0917106  normal  0.176994 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2993  hypothetical protein  28.67 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  25.58 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  27.66 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  27.34 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  26.27 
 
 
172 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  27.78 
 
 
194 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  26.62 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  29.06 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  25.74 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3923  hypothetical protein  29.17 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000169175  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  27.67 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  27.97 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  27.89 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  27.04 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  25.38 
 
 
154 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  25.69 
 
 
160 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2265  hypothetical protein  24.09 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.000466935 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  26.9 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  21.77 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  27.54 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  27.86 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  25.55 
 
 
147 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  25.42 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  26.9 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3820  phage tail protein  23.33 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0449238  normal  0.0664032 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  25.41 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  29.45 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1904  hypothetical protein  21.99 
 
 
144 aa  47.4  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0753341  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  25 
 
 
152 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0803  conserved hypothetical phage tail protein  26.05 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  23.77 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  24.6 
 
 
146 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  23.7 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  23.4 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  26.43 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  24.35 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  22.64 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  23.08 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>