78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1039 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  296  8e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  76.26 
 
 		 146 aa  235  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  65 
 
 		 142 aa  211  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  56.94 
 
 		 147 aa  179  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  57.25 
 
 		 143 aa  173  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  52.11 
 
 		 152 aa  169  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  53.15 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  52.14 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  53.74 
 
 		 157 aa  157  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  50.72 
 
 		 146 aa  155  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  50.72 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3923  hypothetical protein  49.64 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000169175  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2993  hypothetical protein  37.31 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  39.86 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  42.15 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  37.5 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  36.81 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  39.86 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  37.41 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  38.41 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  35.21 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  39.5 
 
 		 178 aa  87  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  38.41 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  34.07 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  40.65 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  35.03 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  34.01 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  35.42 
 
 		 160 aa  80.1  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  31.39 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  32.43 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  35.04 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  33.1 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  34.81 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  31.16 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  33.57 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  34.67 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  35.21 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1823  phage tail protein  33.33 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  27.46 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5253  hypothetical protein  31.33 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00063173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  31.39 
 
 		 179 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  33.09 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  32.19 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  31.29 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  31.01 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  30.22 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  32.85 
 
 		 158 aa  67  0.00000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  32.21 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  30.82 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1826  phage tail protein  27.52 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2943  hypothetical protein  25.9 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0679  hypothetical protein  28.47 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  28.67 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  25.19 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0831  hypothetical protein  27.89 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  29.27 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  30.14 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0761  hypothetical protein  28.48 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00269614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  31.29 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  28.77 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1904  hypothetical protein  29.06 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0753341  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0803  conserved hypothetical phage tail protein  30.32 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  29.85 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  30.82 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  25.34 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  30.66 
 
 		 194 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  27.35 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2265  hypothetical protein  27.69 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.000466935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  24.66 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1129  hypothetical protein  26.35 
 
 		 169 aa  50.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  24.64 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0928  phage tail protein  25.58 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0917106  normal  0.176994 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1423  hypothetical protein  26.8 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3820  phage tail protein  23.57 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0449238  normal  0.0664032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  27.96 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  27.96 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4384  hypothetical protein  23.88 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.349994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>