12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0421 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0421  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  1013    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0730  hypothetical protein  51.04 
 
 		 490 aa  528  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1661  hypothetical protein  33.26 
 
 		 474 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2611  hypothetical protein  27.79 
 
 		 527 aa  104  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0107  hypothetical protein  24.43 
 
 		 527 aa  98.6  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138726 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3891  hypothetical protein  26.71 
 
 		 521 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4095  hypothetical protein  27.02 
 
 		 521 aa  89  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1801  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 		 507 aa  84.7  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.679087  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0724  hypothetical protein  25.22 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0342  hypothetical protein  28.04 
 
 		 639 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.894241  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3106  hypothetical protein  30 
 
 		 506 aa  57  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0301  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.9 
 
 		 512 aa  55.5  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.141921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>