26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0375 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0375  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  778    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4139  hypothetical protein  36.89 
 
 		 376 aa  286  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03982  hypothetical protein  30.6 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.47471  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1789  hypothetical protein  28.74 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4190  hypothetical protein  28.77 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5355  hypothetical protein  30.16 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3985  hypothetical protein  27.86 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29120  hypothetical protein  28.2 
 
 		 361 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446947 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1600  hypothetical protein  28.83 
 
 		 357 aa  155  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.867208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1582  hypothetical protein  27.59 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422595  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1412  hypothetical protein  27.81 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3903  hypothetical protein  26.44 
 
 		 356 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3749  hypothetical protein  27.35 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4093  hypothetical protein  27.57 
 
 		 357 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4572  hypothetical protein  26.98 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1317  hypothetical protein  26.98 
 
 		 357 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2262  hypothetical protein  24.37 
 
 		 413 aa  136  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12788  hypothetical protein  26.27 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.405764  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3872  hypothetical protein  25.66 
 
 		 357 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0193  hypothetical protein  24.93 
 
 		 397 aa  113  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0142  hypothetical protein  36.84 
 
 		 541 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0125  hypothetical protein  36.18 
 
 		 541 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1873  hypothetical protein  22.99 
 
 		 385 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146136  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1794  hypothetical protein  22.99 
 
 		 385 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1745  hypothetical protein  21.7 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.886322  normal  0.285515 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2083  hypothetical protein  22.87 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>