19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3295 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1062  putative lipoprotein  100 
 
 
150 aa  294  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3295  putative lipoprotein  100 
 
 
150 aa  294  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3516  putative lipoprotein  100 
 
 
150 aa  294  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.699478 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3391  putative lipoprotein  99.33 
 
 
150 aa  292  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0976  putative lipoprotein  88.67 
 
 
150 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0972  putative lipoprotein  89.33 
 
 
150 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1010  putative lipoprotein  89.33 
 
 
150 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4061  putative lipoprotein  71.61 
 
 
155 aa  221  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0968  putative lipoprotein  77.92 
 
 
152 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0905  putative lipoprotein  74.17 
 
 
152 aa  191  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3407  putative lipoprotein  54.78 
 
 
157 aa  180  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2209  hypothetical protein  51.11 
 
 
83 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2181  hypothetical protein  51.11 
 
 
83 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2221  hypothetical protein  46.77 
 
 
86 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.700232  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2832  hypothetical protein  56.6 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3695  hypothetical protein  51.56 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0221035 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4399  hypothetical protein  48 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.95537  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0736  hypothetical protein  36.36 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.912503  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3399  hypothetical protein  47.83 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0815274  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>