17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1305 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1305  hypothetical protein  100 
 
 
58 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0743  hypothetical protein  82.76 
 
 
231 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104766 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05049  hypothetical protein  72.73 
 
 
232 aa  77  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5076  Gp5 domain-containing protein  43.1 
 
 
323 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1446  Gp5 domain-containing protein  45.61 
 
 
359 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2743  Gp5 domain-containing protein  45.61 
 
 
359 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0564  hypothetical protein  50 
 
 
364 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.636902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0680  Gp5 domain-containing protein  43.1 
 
 
323 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0263  Gp5 domain protein  42.11 
 
 
360 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.791542  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0926  hypothetical protein  53.85 
 
 
565 aa  53.9  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0722  hypothetical protein  49.12 
 
 
321 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4921  hypothetical protein  43.86 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3470  phage protein  50.85 
 
 
567 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394685 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2914  phage protein  51.92 
 
 
567 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000301579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2779  phage protein  51.92 
 
 
567 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00246067  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1049  hypothetical protein, putative phage gene  48.98 
 
 
541 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0918  hypothetical protein  45.9 
 
 
551 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>