24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0472 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3852  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3796  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110754  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0472  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.088779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3978  hypothetical protein  99.17 
 
 
121 aa  248  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3346  hypothetical protein  98.33 
 
 
121 aa  244  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0514  hypothetical protein  95.87 
 
 
135 aa  240  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3518  hypothetical protein  95.87 
 
 
121 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0513  hypothetical protein  95.87 
 
 
121 aa  239  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.819192  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0513  hypothetical protein  95.87 
 
 
121 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3283  hypothetical protein  89.17 
 
 
121 aa  224  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3591  hypothetical protein  87.39 
 
 
121 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3192  hypothetical protein  81.82 
 
 
123 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0536  hypothetical protein  70.83 
 
 
123 aa  186  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0213878  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4086  hypothetical protein  73.28 
 
 
121 aa  183  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0551  hypothetical protein  72.03 
 
 
121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3361  hypothetical protein  69.49 
 
 
127 aa  174  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0746903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  24.55 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  26.13 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  22.88 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  21.67 
 
 
120 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  25 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  25 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  25 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  25 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>