23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0314 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0319  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0318  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0314  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0313  hypothetical protein  98.63 
 
 
73 aa  140  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.487449  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0315  hypothetical protein  94.52 
 
 
73 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.90376  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0417  hypothetical protein  94.52 
 
 
73 aa  137  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3709  hypothetical protein  91.78 
 
 
73 aa  137  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0310  hypothetical protein  91.78 
 
 
73 aa  137  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.351584 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4402  hypothetical protein  90.41 
 
 
74 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3546  hypothetical protein  83.56 
 
 
73 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.208277  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3405  hypothetical protein  86.3 
 
 
73 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3449  hypothetical protein  79.45 
 
 
75 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.166822  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0330  hypothetical protein  75 
 
 
74 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233158  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0608  hypothetical protein  69.01 
 
 
74 aa  109  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.51686  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0301  hypothetical protein  60 
 
 
75 aa  83.6  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.343727  hitchhiker  0.0000000789061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4619  hypothetical protein  60 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.668984  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3910  hypothetical protein  59.46 
 
 
75 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3952  hypothetical protein  58.11 
 
 
75 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3711  hypothetical protein  56.76 
 
 
80 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.665558 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03528  hypothetical protein  55.84 
 
 
80 aa  77.8  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000347587  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2598  hypothetical protein  52.05 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.103252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4248  hypothetical protein  50 
 
 
166 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7172  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3431  hypothetical protein  56.34 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>