25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3197 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3197  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  351  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.367183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1193  hypothetical protein  98.24 
 
 
170 aa  347  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148089  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1161  hypothetical protein  98.82 
 
 
170 aa  346  7e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1102  hypothetical protein  98.24 
 
 
170 aa  345  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1089  hypothetical protein  88.02 
 
 
169 aa  314  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.429336  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2923  hypothetical protein  79.29 
 
 
170 aa  285  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3005  hypothetical protein  79.29 
 
 
170 aa  285  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195237  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1262  hypothetical protein  78.11 
 
 
170 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3102  hypothetical protein  79.88 
 
 
170 aa  280  9e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0275  hypothetical protein  60.31 
 
 
163 aa  169  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000890841  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02213  hypothetical protein  34.57 
 
 
173 aa  117  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0542  hypothetical protein  26.47 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1309  hypothetical protein  25.16 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000696984  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3908  hypothetical protein  23.19 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4102  hypothetical protein  25.16 
 
 
173 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4580  hypothetical protein  20.57 
 
 
173 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12007  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1577  hypothetical protein  21.05 
 
 
174 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3642  hypothetical protein  23.65 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3887  hypothetical protein  24.38 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1402  hypothetical protein  25.71 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156265  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1785  hypothetical protein  19.35 
 
 
174 aa  42  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0605604  normal  0.726112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0214  hypothetical protein  27.72 
 
 
170 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3019  hypothetical protein  27.44 
 
 
171 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2338  hypothetical protein  25.19 
 
 
176 aa  41.6  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0431424  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2617  hypothetical protein  25.19 
 
 
176 aa  41.6  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53059  normal  0.0347471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>