23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1147 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1225  hypothetical protein  84.3 
 
 
792 aa  1410    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1147  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
793 aa  1646    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000254962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3541  type IV pilus assembly PilZ  59.37 
 
 
805 aa  1026    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0300151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3359  type IV pilus assembly PilZ  99.12 
 
 
793 aa  1632    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3033  type IV pilus assembly PilZ  55.97 
 
 
805 aa  946    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3371  type IV pilus assembly PilZ  62.97 
 
 
804 aa  1077    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3221  type IV pilus assembly PilZ  98.74 
 
 
793 aa  1630    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2815  type IV pilus assembly PilZ  85.61 
 
 
795 aa  1434    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2808  type IV pilus assembly PilZ  58.62 
 
 
796 aa  988    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000659651 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3220  type IV pilus assembly PilZ  89.41 
 
 
804 aa  1486    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0980  hypothetical protein  61.14 
 
 
792 aa  1036    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.218662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1048  type IV pilus assembly PilZ  85.32 
 
 
790 aa  1430    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.023963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1009  type IV pilus assembly PilZ  61.19 
 
 
794 aa  1009    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1109  type IV pilus assembly PilZ  85.06 
 
 
790 aa  1429    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.618893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1044  type IV pilus assembly PilZ  85.32 
 
 
790 aa  1436    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.713733  hitchhiker  0.00851048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1034  type IV pilus assembly PilZ  54.4 
 
 
796 aa  877    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1279  type IV pilus assembly PilZ  27.99 
 
 
840 aa  317  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02992  type IV pilus assembly PilZ  28.29 
 
 
841 aa  307  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.488872  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1923  hypothetical protein  28.12 
 
 
779 aa  282  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.453342  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002635  hypothetical protein  27.1 
 
 
782 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.729255  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03371  hypothetical protein  26.62 
 
 
782 aa  277  5e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0625  hypothetical protein  25.72 
 
 
781 aa  258  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.432521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1106  hypothetical protein  25.06 
 
 
822 aa  228  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>