21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3105 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3105  FlgN family protein  100 
 
 
141 aa  276  8e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2967  FlgN family protein  99.29 
 
 
141 aa  274  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2952  FlgN family protein  99.29 
 
 
141 aa  274  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.409825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1411  FlgN family protein  98.58 
 
 
141 aa  273  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2602  FlgN family protein  87.94 
 
 
141 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.813191  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1254  FlgN family protein  85.11 
 
 
141 aa  235  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1324  FlgN family protein  85.11 
 
 
141 aa  235  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1316  FlgN family protein  84.4 
 
 
141 aa  234  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3255  flagellar biosynthetic protein FlgN  85.11 
 
 
141 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1156  FlgN family protein  59.71 
 
 
157 aa  157  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1592  FlgN family protein  56.03 
 
 
141 aa  153  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.89295  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1340  FlgN family protein  58.87 
 
 
141 aa  152  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1298  FlgN  58.16 
 
 
141 aa  149  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3092  FlgN family protein  56.03 
 
 
141 aa  148  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1335  FlgN family protein  53.9 
 
 
141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301574  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2323  flagellar biosynthetic protein FlgN  52.25 
 
 
144 aa  107  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.697168  normal  0.220477 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01279  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway chaperone  29.08 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2343  polar flagellar FlgN, putative chaperone  28.26 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.312185  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004178  flagellar biosynthesis protein FlgN  27.66 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1471  putative flagellar protein FlgN  32.28 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1797  hypothetical protein  26.95 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>