67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1703 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  341  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  341  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  341  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  99.41 
 
 
169 aa  338  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  94.08 
 
 
169 aa  327  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  93.49 
 
 
169 aa  327  6e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  92.31 
 
 
169 aa  324  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  92.31 
 
 
169 aa  324  5e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  92.31 
 
 
169 aa  323  6e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  78.11 
 
 
169 aa  285  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  78.92 
 
 
168 aa  280  9e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  76.19 
 
 
168 aa  278  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  78.92 
 
 
168 aa  274  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  77.84 
 
 
167 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  73.96 
 
 
169 aa  270  6e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  77.99 
 
 
159 aa  263  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  58.58 
 
 
169 aa  214  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  58.68 
 
 
169 aa  210  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  55.03 
 
 
174 aa  209  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  58.08 
 
 
169 aa  209  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  59.17 
 
 
169 aa  208  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  55.03 
 
 
176 aa  203  9e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  55.62 
 
 
180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  50 
 
 
174 aa  194  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  47.93 
 
 
208 aa  170  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  45.56 
 
 
172 aa  168  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  46.78 
 
 
174 aa  167  9e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  45.73 
 
 
177 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  45.12 
 
 
177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  49.1 
 
 
212 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  43.2 
 
 
175 aa  160  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  49.04 
 
 
210 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  45.56 
 
 
175 aa  159  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  47.5 
 
 
188 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  42.6 
 
 
177 aa  155  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  44.51 
 
 
185 aa  148  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  49.33 
 
 
163 aa  145  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  44.64 
 
 
171 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  45.83 
 
 
198 aa  141  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  42.51 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  45.86 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  42.14 
 
 
196 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  37.58 
 
 
186 aa  115  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  34.25 
 
 
197 aa  110  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  34.81 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  34.91 
 
 
179 aa  107  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  38.04 
 
 
178 aa  104  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  32.39 
 
 
198 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  33.33 
 
 
163 aa  89  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  32.58 
 
 
163 aa  88.2  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  32.76 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  31.52 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  37.86 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  32.1 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  28.07 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  30.23 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  30.3 
 
 
181 aa  70.9  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  32.14 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  29.11 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  29.6 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  30.22 
 
 
165 aa  54.7  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  27.54 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  29.17 
 
 
160 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  27.41 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  29.73 
 
 
187 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  37.8 
 
 
171 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  27.73 
 
 
165 aa  41.6  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>